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STR/SSR微卫星分型

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产品名称: STR/SSR微卫星分型

英文名称: STR,SSR

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北京君诺德生物技术有限公司
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微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法,费时费力效率低。我们利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确。

3.1 服务项目:
1.多态性引物开发:对于全基因组序列未知的物种,富集含SSR序列的DNA片段,开发出10-30条具有多态性的微卫星序列和引物。
2.多态性引物筛选:针对含微卫星的序列信息或引物和目标样本,筛选出具有多态性的引物。
3.样本批量扩增:用带有荧光标记(FAM/HEX/TMR/ROX等)的引物,对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR仪平台,可以满足大量样本扩增需求。
4.测序仪检测:带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合,用3730xl等测序仪进行毛细管电泳,并得到原始数据。
5.原始数据分析:编制panel和bin等文件,使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件,并生成PDF图谱和Excel文档(包括size、基因分型等信息),分析后的电泳图谱。
3.群体多态性研究:对于已筛选好的多态性引物和群体性样本,进行批量检测,并进行遗传学分析。

3.2 送样要求:
细胞(≥106 )、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(≥20μl,浓度≥ 50ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。

3.3 提供结果:
 引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。