高通量测序数据分析服务

服务简介：
随着第二代测序技术的广泛应用，各类测序结果的海量数据不断产生，需要凭借专业的人员和方法对数据进行各种
分析和统计，才能得到有效的所需信息。
英为信生物建立了成熟的高通量测序数据的分析流程，有着经验丰富的生物信息学分析团队，可以为您提供不同研究
应用的数据分析。

果蝇转录组基因组定位与分析图

服务内容：
基本数据分析：
1. 序列前处理工作，包括成对测序数据的序列匹配，裁减低质量部分，数据格式转换等
2. 序列拼接，Scaffolding，对454 数据的homopolymer 进行修正等
3. 用多种主流基因预测软件预测基因并挑选最合适的代表基因结构
4. tRNA/rRNA 识别和分类，基因组GC 含量分析，并识别特异区域
5. 基因功能注释（包括同源注释和蛋白结构域识别），基因功能分类（基于GO 或COG）
 
生物信息高级分析：
1.提供图形化界面由用户人工确认基因结构和基因功能注释
2.重复序列识别和分类，基因家族识别和聚类
3.基因功能聚类，参照FunCatDB 标准；代谢调控途径识别和重建
4.转录因子、分泌蛋白、蛋白激酶、转运蛋白、假基因的识别和分析
5.Synteny block 分析与其他比较基因组分析
 
转录组深度测序分析：
1.深度测序Mapping 和表达差异统计分析、cSNP 识别
2.依据表达量进行基因功能聚类，由已知基因推断未知基因功能
 
基因组数据库构建：
1.项目整体介绍、BLAST 序列比对界面、基因组总体结构浏览界面（GenomeBrowser）
2.分类基因浏览界面（FunCatDB／Gene Ontology 树形浏览各类别的基因）
3.有特色的基因家族或代谢调控途径浏览界面（需用户提供验证过的数据）
 
分析流程：
1.数据质量评价 
2.研究应用分析，确定数据分析目标与方案 
3.计算处理，采用超级计算机对海量数据进行分析 
4.结果统计 
 
品质保证:
1.大量不同类型二代测序数据分析经验 
2.严格分析流程质控 
3.充分了解客户需求，并保持分析过程密切沟通