皮肤微生物多样性分析

产品内容：

提供皮肤微生物多样性分析的整套方案：“实验规划->样本采集->肠道微生物序列测定->生信统计学分析->论文协助”。

样品采集：

可为客户提供样品采集棉签和样品保存器皿。

检测平台：

Illumina、Ion PGM、PacBio等高通量测序分析、PCR-DGGE、实时荧光定量PCR、克隆文库等多种微生物多样性分析平台。

送样要求：

不同的样本类型，送样要求不一样。

详情请咨询公司技术热线4006609270。

联系方式

技术咨询热线 /企业QQ：400-660-9270    

电话询价：021-31606760/021-31606761

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　　样品采集及运送：

　　新鲜样品：根据相关文献收集样品

　　DNA样品：浓度大于10 ng/uL，总量大于500 ng的基因组DNA，DNA纯度较差或降解会影响后继的扩增实验。如果方便的话，可提供电子版DNA电泳检测照片及 OD260/280的比值。

　　样品运送：送样时采用干冰保存运输；若是距离较远，建议采用干冰加冰袋，存放于冰盒中。

• 高通量测序流程：

案例分析

标题：人体皮肤微生物的多样性概况

研究领域：皮肤微生物

分析物种：细菌

取样方法：取皮肤表皮及皮下组织

　　高通量测序平台：Illumina MiSeq 2×150

　　测序区域：16S rRNA gene V4区

主要结果：
（1）无皮肤病史的五个样本左、右手的113个OUT的系统发育树结构丰度

（2）OUT单板描述

（3）.该图展示了样品根据它们Θ指数用UPGMA得到的发育树

（4）.相对丰度比较

原文链接：http://genome.cshlp.org/content/18/7/1043.short

参考文献：
Grice, E. A., H. H. Kong, G. Renaud, A. C. Young, G. G. Bouffard, R. W. Blakesley, T. G. Wolfsberg, M. L. Turner and J. A. Segre (2008). “A diversity profile of the human skin microbiota.” Genome Research 18(7): 1043-1050.